La complessità della biologia
La biologia non è mai semplice. Mentre i ricercatori avanzano nella lettura e modifica dei geni per trattare le malattie, emerge sempre più evidenza che le proteine e i metaboliti che circondano quei geni non possono essere ignorati. La spinout del MIT, ReviveMed, ha sviluppato una piattaforma per misurare i metaboliti — prodotti del metabolismo come lipidi, colesterolo, zuccheri e carboidrati — su larga scala. L’azienda utilizza queste misurazioni per scoprire perché alcuni pazienti rispondono ai trattamenti mentre altri no e per comprendere meglio i fattori che guidano le malattie.
La sfida della misurazione
Storicamente, siamo stati in grado di misurare alcune centinaia di metaboliti con alta precisione, ma questo rappresenta solo una frazione dei metaboliti presenti nei nostri corpi. C’è un enorme divario tra ciò che misuriamo con precisione e ciò che esiste nel nostro corpo, ed è questo che vogliamo affrontare. Vogliamo attingere agli insight potenti derivanti dai dati sui metaboliti poco utilizzati. Il progresso di ReviveMed arriva mentre la comunità medica più ampia sta sempre più collegando i metaboliti disregolati a malattie come il cancro, l’Alzheimer e le malattie cardiovascolari.
Collaborazioni e innovazioni
ReviveMed sta utilizzando la sua piattaforma per aiutare alcune delle più grandi aziende farmaceutiche del mondo a trovare pazienti che possono beneficiare dei loro trattamenti. Sta anche offrendo software ai ricercatori accademici gratuitamente per aiutare a ottenere insight dai dati sui metaboliti non sfruttati. Con il campo dell’AI in piena espansione, crediamo di poter superare i problemi di dati che hanno limitato lo studio dei metaboliti. Non esiste un modello di base per la metabolomica, ma vediamo come questi modelli stanno cambiando vari campi come la genomica, quindi stiamo iniziando a pionierizzare il loro sviluppo.
Un viaggio di scoperta
Pirhaji è nata e cresciuta in Iran prima di arrivare al MIT nel 2010 per perseguire il suo dottorato in ingegneria biologica. Aveva precedentemente letto i documenti di ricerca di Fraenkel ed era entusiasta di contribuire ai modelli di rete che stava costruendo, integrando dati da fonti come genomi, proteomi e altre molecole. Stavamo pensando al quadro generale in termini di ciò che si può fare quando si può misurare tutto — i geni, l’RNA, le proteine e le piccole molecole come i metaboliti e i lipidi.
La visione di ReviveMed
Probabilmente siamo in grado di misurare solo qualcosa come lo 0,1 percento delle piccole molecole nel corpo. Pensavamo che dovesse esserci un modo per ottenere una visione altrettanto completa di quelle molecole come abbiamo per le altre. Ciò ci permetterebbe di mappare tutti i cambiamenti che si verificano nella cellula, sia nel contesto del cancro che dello sviluppo o delle malattie degenerative. A metà del suo dottorato, Pirhaji ha inviato alcuni campioni a un collaboratore presso l’Università di Harvard per raccogliere dati sul metaboloma — le piccole molecole che sono i prodotti dei processi metabolici.
Fonte: MIT
foto credit: Image: MIT News; iStock
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